單一腎囊腫的唯一危害就是可能發展成惡性囊腫，不過這很少發生。而多囊腎的危害則不同，多囊腎病隨囊腫增大的過程可能出現腎臟功能細胞的損傷，多囊腎的危害也隨之產生即多囊腎導致慢性終末期腎功能衰竭尿毒癥的發生。并且多囊腎腎功能不全在臨床中比較常見。
多囊腎腎功能不全發生以后多囊腎患者往往會出現不同程度的并發癥，如高血壓、惡心、嘔吐等不適。多囊腎的危害也就以多囊腎腎功能不全的出現為著。多囊腎的危害是多囊腎腎功能不全后出現的臨床癥狀為表現。多囊腎患者往往早期并未注意到多囊腎的危害，粗心大意不好好針對自己的病情入手到后來多囊腎腎功能不全發生以后，尤其是終末期腎功能衰竭尿毒癥發生后，多囊腎商人體內的毒素無法正常排出體外，毒素長期在身體內滯留出現癥狀以后，不得不進行血液透析時才能意識到多囊腎的危害。
所以，多囊腎患者應從日常生活中注意保健，從開始就了解多囊腎的危害在日常飲食等方面照顧好自己，避免因過分大意而致多囊腎腎功能不全的出現。
如患有單一性腎囊腫，往往在因其他疾病進行檢查時，才被發現。由于囊腫會有癌細胞的一點可能，所以醫生會叫你接受進一步的檢查——一例如做超聲波檢查。至于醫生還會讓你做囊腫吸引手術時，應慎重考慮腎囊腫開放式治療有復發，反復的危險。如果囊腫液體內的細胞檢查結果一切正常，而囊腫也沒有擴大到足以造成腎損傷或引起極度不適，通常你就不需要進一步的診治。但如果囊腫變大、造成疼痛，應該盡早采取保守治療。
而對于多囊腎的治療則要堅持早發現、早治療的原則，而多囊腎治療過程中應避免開放式手術對腎臟造成進一步損傷。減少因治療不當增加多囊腎的危害，過早出現腎功能不全。
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